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Enzymologie (inhibition compétitive) [1931]

moutakapam

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Neutrino
4 messages postés


Posté le : 02/06/2012 à 06:48 (Lu 2899 fois)
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Salut,

Une cellule (10^-12 L) contient 93*10^6 molécules (Na=6.02*10^23) de substrat S.
La réaction S--->P a lieu sous l'action d'une enzyme E.
Km=2*10^-4 M Ki=2*10^-5 M
Quelle devrait être la concentration en inhibiteur compétitif pour que la réaction enzymatique soit inhibée de 40%?

Où j'en suis arrivée:
Pour une réaction enzymatique sans inhibiteur, j'écris: vo=(vmax*[S]) / (Km +[S])
Pour une réaction enzymatique avec inhibiteur compétitif, j'écris: vo'= (vmax'*[S]) / ((Km*alpha) +[S] ) avec alpha=1+([I]/Ki)
Maintenant, je sais qu'avec un inhibiteur compétitif, vmax ne change pas, dc je peux écrire: vmax=vmax'
Je résouds l'équation et j'obtiens au final: [I]=-3.73*10^42 M (bizarre: la valeur est négatif ce qui logiquement est impossible et l'ordre de grandeur me paraît très élevé).
J'ai oublié de dire que vo'=0.6*vo

Merci énormément.

Re: Enzymologie (inhibition compétitive)

Maurice
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647 messages postés


Posté le : 03/06/2012 à 09:45 (Lu 2891 fois)
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Qu'est-ce que tu appelles Km, Ki, vo et vo' ?

Re: Enzymologie (inhibition compétitive) [1939]

moutakapam

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Neutrino
4 messages postés


Posté le : 04/06/2012 à 12:37 (Lu 2887 fois)
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Km est la constante de dissociation de la réaction ES<--->E+S
Elle correspond à la concentration en substrat S lorsque vo=vmax/2. Elle correspond aussi à l'affinité qu'à une enzyme pour son substrat.
vo est la vitesse de la réaction enzymatique E+S<---->ES---->E+P Quant à vo', c'est la vitesse de la réaction enzymatique en présence d'un inhibiteur compétitif.
Ki est la constante d'affinité qu'à une enzyme pour un inhibiteur donné, elle correspond aussi à la constante de dissociation de la réction: E+I<--->EI

Re: Enzymologie (inhibition compétitive) [1940]

Maurice
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Posté le : 06/06/2012 à 05:44 (Lu 2881 fois)
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Un résultat comme 10^42 M est manifestement impossible. Mais 10^42 molécules, c'est presque le carré du nombre d'Avogadro...
Est-ce que tu n'aurais pas confondu le nombre de molécules et le nombre de moles ?

Re: Enzymologie (inhibition compétitive) [1941]

moutakapam

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Neutrino
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Posté le : 06/06/2012 à 09:12 (Lu 2874 fois)
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Non je ne crois pas avoir confondu. Mais est ce que 93 millions de molécules de substrat dans une cellule est raisonnable? Les valeurs m'importent peu ce qui m'interesse, c'est plutôt le raisonnement, la méthode de calcul. Qu'en pensez vous ?

Re: Enzymologie (inhibition compétitive) [1942]

Maurice
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647 messages postés


Posté le : 06/06/2012 à 09:40 (Lu 2873 fois)
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93 millions c'est à peu près 108 molécules, donc 108/6·1023 = 1.5·10-16 mole.
Dans un volume de 10-12 litre, cela fait une concentration de 0.00015 mol par litre. C'est raisonnable.

Re: Enzymologie (inhibition compétitive) [1943]

moutakapam

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Neutrino
4 messages postés


Posté le : 06/06/2012 à 17:20 (Lu 2865 fois)
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Bingo, je viens de comprendre mon erreur:

Ce que j'avais fait:
c=n/V=((6.02*10^23)*(93*10^6))/(10^-12)
Ce qui fallait faire:
n=(93*10^6)/(6.02*10^23)
Et je trouve comme résultat final [I]=2.33*10^-5 M , ce qui paraît plus rationnel!!
Merci!!!

Re: Enzymologie (inhibition compétitive) [1944]

Maurice
Administrateur

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647 messages postés


Posté le : 07/06/2012 à 03:17 (Lu 2864 fois)
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Pour éviter pareille méprise à l'avenir, tu aurais intérêt à mettre les unités dans tes calculs, ou même à ne travailler qu'avec les unités, sans valeurs numériques.

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